Anales de la RANM

169 A N A L E S R A N M R E V I S T A F U N D A D A E N 1 8 7 9 DATOS Y ALGORITMOS QUE CURAN Dopazo J An RANM. 2026;143(02): 167 - 173 holística, más centrada en la funcionalidad de la célula. En numerosas enfermedades, incluida la oncogénesis, la información relevante no reside únicamente en qué genes están alterados, sino en qué funciones celulares se activan o inhiben como consecuencia de dichas alteraciones. Esta idea conecta con el marco de los hallmarks del cáncer, en el que procesos como la prolifera- ción sostenida, la evasión de la apoptosis o la inestabilidad genómica constituyen capacidades funcionales adquiridas por las células tumorales (15). El modelado de rutas permite cuantificar estas funciones y compararlas entre condiciones, pacientes o estadios de enfermedad. Un ejemplo ilustrativo, descrito en la publicación original de la metodología, procede del cáncer. La actividad de los circuitos relacionados con distintos hallmarks de cáncer, como la replica- ción del ADN o la resistencia a la apoptosis, etc. (ver Figura 1) está asociada significativa- mente a la supervivencia de los pacientes, como se puede ver en el estudio realizado tomando datos de expresión génica de biopsias de cáncer de riñón disponibles en el repositorio del genoma del cáncer (16). Además, esta actividad está más asociada al pronóstico que la expresión individual de cualquiera de los genes que lo integran. Esta observación refleja una propiedad fundamental de los sistemas biológicos: el sistema es más que la suma de sus partes. Diferentes tumores pueden utilizar programas de expresión génica distintos para activar una misma función celular, lo que hace necesario analizar la arquitectura funcional de las rutas y no solo sus componentes aislados (17). Más allá de la mera descripción de la biología detrás del cáncer, los modelos matemáticos mecanísticos ofrecen la posibilidad de realizar predicciones causales. Una vez que un circuito molecular está representado como modelo mecanístico, se Figura 1. Asociación entre la actividad de funciones celulares y la supervivencia de los pacientes. Curvas de supervivencia de Kaplan–Meier correspondientes a cuatro funciones biológicas relevantes inferidas a partir de circuitos funcionales elementales. En todos los paneles, la línea verde continua representa el grupo con actividad normal, mientras que las líneas discontinuas re- presentan alteraciones funcionales: sobreexpresión en (A) replicación del ADN, (B) antiapoptosis y (C) regulación positiva de la angiogénesis, e infraexpresión en (D) adhesión celular. En los cuatro casos, las alteraciones funcionales se asocian con una menor supervivencia en comparación con el estado normal. Las cruces sobre las curvas indican observaciones censuradas. El tiempo se expresa en días.

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